Koronavirusmuunnoksia tunnistetaan myös jätevedestä – ensimmäiset havainnot omikronista joulukuussa
THL:n jätevesiseurannalla tunnistetaan koronavariantteja jätevesinäytteistä. Koronavirusvarianttien tunnistaminen jätevedestä on mahdollista kehittyneillä sekvensointitekniikoilla, vaikka koronaviruksen perimäaines, virus-RNA, on jätevedessä laimentuneena ja se voi olla vioittunut ympäristötekijöiden vaikutuksesta.
Koronavirusvarianttien tunnistaminen jätevedestä on mahdollista kehittyneillä sekvensointitekniikoilla.
THL aloitti menetelmän kehittämisen koronavirusmuunnosten tunnistamiseksi jätevesinäytteistä viime vuoden loppupuolella. Ensimmäinen varmistunut havainto omikronvariantista jätevedestä Suomessa saatiin Espoon Suomenojan jätevedenpuhdistamolle saapuvasta puhdistamattoman jäteveden näytteestä, joka oli kerätty itsenäisyyspäiväviikolla 6.-7.12.2021, kertoo THL verkkosivustollaan
Myös Helsingin jätevedessä oli havaittavissa viitteitä omikronista, mutta havainto jäi kuitenkin epävarmaksi. Helsingin Viikinmäen jätevedenpuhdistamolta 12.-13.12.2021 kerätystä näytteestä havainto omikronvariantista varmistui.
Omikronia havaittiin lisää seuraavalla viikolla eli 19.-20.12.2021 kerätyistä näytteistä, jolloin muunnosta löytyi HUS-alueella Helsingin Viikinmäen, Pirkanmaalla Tampereen Viinikanlahden, Pohjois-Karjalassa Joensuun Kuhasalon, Satakunnassa Porin Luotsinmäen ja Varsinais-Suomessa Turun Kakolanmäen jätevedenpuhdistamoilta. Omikronhavainto jätevedessä jäi epävarmaksi Pohjois-Savossa Kuopion Lehtoniemen puhdistamolta kerätyssä näytteessä. Aiemmilla viikoilla ja muilla seurantapaikkakunnilla omikronmuunnosta ei ole havaittu.
- Omikronvariantin jätevesilöydökset ajoittuivat ajankohtaan, jolloin omikronin osuus alkoi lisääntyä alueen väestöllä todetuissa koronavirustartunnoissa ennen joulua.
THL:n mukaan vielä marraskuussa kaikki jätevesistä tehdyt havainnot koronavirusmuunnoksista edustivat deltavarianttia. Joulukuussa tutkituissa jätevesissä oli ensin havaittavissa pelkästään deltamuunnosta ja sitten deltamuunnoksen ohella omikronmuunnosta.
THL tiedotti 2.12.2021 ensimmäisestä omikronvariantin aiheuttamasta koronavirustartunnasta, jonka jälkeen muunnoksen aiheuttamia tartuntoja on varmistettu enenevässä määrin. Tällä hetkellä omikronmuunnos on tulossa tai on jo tullut valtavirus valtaosalla alueista.
Jätevesiseuranta jatkuu viikoittain
Koronaviruksen RNA-lukumäärä tutkitaan viikoittain 13 paikkakunnan jätevesinäytteistä: Espoon, Helsingin, Hämeenlinnan, Joensuun, Jyväskylän, Kouvolan, Kuopion, Lappeenrannan, Oulun, Porin, Tampereen, Turun ja Vaasan jätevedenpuhdistamoilta. Lisäksi Rovaniemeltä kerätään näyte kahden viikon välein.
Näytteissä havaitut koronaviruksen RNA-lukumäärät päivittyvät THL:n verkkosivuille jätevesiseurannan viikkoraporttiin kerran viikossa perjantaisin klo 12. Ne jätevesinäytteet, joissa havaitaan koronaviruksen RNA:ta, lähetetään sekvensoitavaksi koronavirusmuunnosten varalta.
